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Que yo sepa, el tono perfecto no es inescrutable ni invaluable. Los niños que crecen escuchando idiomas tonales como el chino tienen muchas más probabilidades de desarrollar un tono perfecto que otros niños, lo que indica que hasta cierto punto se puede aprender. (Esto es algo que escuché en la radio hace algún tiempo). El valor del tono perfecto para los músicos, creo, también se considera dudoso; Ciertamente no es un requisito. El tono relativo es bastante fácil de aprender y puede servir también, si no mejor. Tono absoluto
No conozco ninguna habilidad importante que no se pueda aprender en programación o matemáticas. Algunas personas son excelentes calculadoras mentales, una habilidad a veces asociada con el autismo, pero las personas neurotípicas pueden aprender las mismas habilidades, como muestran los concursos de cálculo mental. Es probable que los autistas con sorprendentes habilidades mentales los hayan ganado en gran medida gracias a la práctica prolongada. Y, como el tono perfecto, el cálculo mental es de dudoso beneficio para las matemáticas o la programación. La única gran calculadora mental que conozco que también fue un gran matemático fue Gauss.
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La memoria es, supongo, similar. Algunas personas parecen tener recuerdos asombrosos, pero los campeones de la competencia de memoria suelen ser personas normales que simplemente entrenan duro, y de nuevo un recuerdo increíble, aunque suena muy beneficioso, probablemente no haga mucho por los matemáticos (lo cual digo porque empíricamente, excelentes matemáticos no parecen tener recuerdos notables en general).
La sinestesia probablemente no se puede aprender, junto con varias otras rarezas neurológicas del tipo que aprendería de Oliver Sacks. No sé si tales cosas son especialmente útiles para las matemáticas o la programación. Fue de uno de los libros de Sacks que supe que el topólogo Bernard Morin, quien descubrió una forma de voltear una esfera al revés, creía que su ceguera le daba poderes únicos de visualización. Sin embargo, otras personas parecen haber llegado a los mismos resultados matemáticos. Paradoja de Smale