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Personalmente, cuando estaba en la universidad, me interesaba tanto la teoría como la aplicación. El matrimonio de la teoría y la aplicación es muy interesante para mí. Por ejemplo, investigo en aprendizaje profundo. Los avances teóricos son geniales. Pero poder implementar esas ideas teóricas en el código nos ayuda a ver si es válido en la práctica o no.
La aplicación es excelente si quieres un trabajo de ingeniería de software. No importa si sabes la respuesta en teoría. Necesitas poder implementarlo. La teoría definitivamente te hace pensar muy bien a través de una idea. Pero, la aplicación te permite ver cómo funciona algo.
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Debe averiguar cuál quiere que sea el objetivo de su educación y cuál es su objetivo final antes de inclinarse de una forma u otra. Es bueno ser bueno en ambos, pero si no tienes el tiempo para tomar clases adecuadas para ambos lados, lo pensaría mucho.
¡Buena suerte!