Hay cierta extracción de información que está capacitada en ensayos clínicos en pubmed y medline (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed), índice MESH (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh ) y UMLS para extraer medicamentos, síntomas, enfermedades y efectividad. Algunas de estas herramientas son
- Ytex (http://code.google.com/p/ytex/) Ytex utiliza apache UIMA para la extracción de información, weka para el aprendizaje automático y documentos de índice. Las herramientas se basan en CTakes (http://ohnlp.sourceforge.net/). Ytec utiliza el servidor ms sql para almacenar documentos y resultados. Puede encontrar un esquema de base de datos y un ejemplo de consulta en http://code.google.com/p/ytex/wi…
- MetaMap (http://mmtx.nlm.nih.gov/) es otra extracción de información biomédica, similar a Ytex.
- Kea (http://www.nzdl.org/Kea/download…) puede usarse para extraer frases clave biomédicas (http://www.nzdl.org/Kea/examples…)
Le sugiero que almacene el resultado en el almacén de datos de valor clave. Pero también puede almacenar el resultado en una base de datos con el siguiente esquema. Docid, nombre de identificación de tipo de entidad, nombre de entidad, cuenta.
- Aquí Docid es id para documento
- Nombre El identificador de entidad representa el tipo de entidad nombrada encontrada, que incluye medicamentos, enfermedades, síntomas, etc.
- Nombre de la entidad: – nombre de la entidad nombrada encontrada
- cuenta: cuenta de la entidad nombrada en el documento
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