¿Alguien o compañía alguna vez ha tenido una patente en un país y otra parte la ha patentado abiertamente en otro país y no se puede hacer nada?

Puede suceder fácilmente. Digamos que la compañía A en el país a inventó algo y la compañía B de otro país inventó lo mismo o algo similar dos meses después de forma independiente (sí, algo así sucede realmente todo el tiempo). Cada compañía presenta una patente en su tierra natal respectivamente. Normalmente, las solicitudes de patente se publican 18 meses después de que se haya presentado. Si la empresa A no presenta una solicitud de patente en el país b en un plazo de 12 meses y reclama la prioridad de su primera solicitud en el país by no presenta una solicitud PCT, la empresa A probablemente no pueda hacer nada contra la patente en el país b. Debido a que, en vista del país b, la compañía B es la primera que presentó la invención y gozará de la protección, siempre que la compañía A no haya publicado la invención antes de que la compañía B presente su solicitud de patente.
En términos de robar un invento y patentarlo en otro lugar, la mayoría de los países apoyarán al verdadero inventor. Pero demostrarlo puede ser realmente doloroso y, a veces, imposible.
Normalmente, el primer inventor puede confiar en su solicitud de patente anterior (si se ha presentado una) y reclama el derecho anterior basado en el Convenio de París.

Los examinadores son humanos que también son propensos al error. La mayoría de ellos obtienen una cantidad de tiempo muy pequeña para buscar y examinar una solicitud de patente. Es probable que haya falibilidad en el proceso.

Por la misma razón, la mayoría de los sistemas de patentes vencidos tienen un sistema de oposición, observación, reexamen o revocación, donde el público en general tiene la oportunidad de oponerse o presentar observaciones durante o después del examen.

Es posible. Los examinadores de patentes son humanos después de todo. Pero en la mayoría de los casos esto se puede corregir. La mayoría de los países tienen procedimientos de reexamen u oposición en los que se puede argumentar que una invención en particular se conocía antes de que se presentara para una patente.

Eso solía pasar todo el tiempo.

La ley de novedad de la patente veneciana (1470) actúa hasta justo antes de la AIA en la ley de los Estados Unidos (35 USC 102) alentó eso.

Esto debería suceder cada vez menos en los EE. UU.

El resto del mundo era en su mayoría novedad absoluta … pero alguien aún tendría que refutar la novedad absoluta.

Digamos que alguien robó un invento para un veneno de piel de rana arbórea de la selva de una tribu amazónica en una jungla remota. Digamos que lo trajeron a los EE. UU. Y lo usaron para una terapia médica. ¿Cómo sabrías probar y refutar la novedad absoluta?