Respuesta corta: Sí, actualmente lo hace.
El sistema Jeopardy de Watson se basó más en las técnicas tradicionales de aprendizaje automático en las que los investigadores diseñaron la representación de la entrada y el proceso de aprendizaje automático implicó el aprendizaje del mapeo desde la representación (características) hasta la salida.
La IA detrás de Watson – El artículo técnico
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El aprendizaje profundo puede involucrar tanto el aprendizaje de una representación adecuada de su entrada como el mapeo de la representación a una salida.
Actualmente (febrero de 2016) Watson no es solo un producto único, sino que consiste en un ecosistema completo de productos y servicios. Hay equipos que trabajan en el aprendizaje profundo para mejorar su rendimiento en diferentes problemas.
Parte del trabajo implica investigación sobre aspectos como el reconocimiento de voz:
IBM Watson anuncia un avance en la transcripción del discurso conversacional
Ciertos servicios disponibles comercialmente, como el Clasificador de lenguaje natural (que ayuda a clasificar las preguntas de los usuarios según su intención) tienen un aprendizaje profundo como parte de su proceso de capacitación y clasificación de preguntas:
Documentación del servicio Clasificador de lenguaje natural