Depende de que te parezca más interesante. Si está comenzando con el aprendizaje automático y las interfaces cerebro-computadora, le recomendaría usar un conjunto de datos bien establecido, ya que la grabación y el trabajo en línea (en tiempo real) requieren mucho esfuerzo y experiencia.
El conjunto de competencias de BCI viene a mi mente (BCI Competition IV, ver también versiones anteriores), y la reciente competencia de Kaggle (DecMeg2014 – Decoding the Human Brain) también es bastante interesante.
Uno de los mayores problemas en las interfaces cerebro-computadora es que las señales cerebrales son débiles y muy variables. Es por eso que es difícil entrenar un clasificador y usarlo al día siguiente, y mucho menos usarlo en un tema diferente. Plug descarado: vea mi tesis doctoral sobre este tema (Robustas interfaces cerebro-computadora). La competencia Kaggle mencionada anteriormente se ganó usando un enfoque muy relacionado.
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Este es un tema muy difícil, pero muy interesante. No asumiría el problema completo, pero tal vez puedas hacer mella :).