¿Cómo se puede utilizar el aprendizaje automático para la metabolómica?

Las técnicas de aprendizaje automático ya se utilizan en muchas técnicas de metabolómica (otras ómicas también). Los datos de Omics son datos de alta dimensión. En una sola instancia, en una muestra puede tener algunos cientos de características de metabolitos. La metabolómica también es muy diferente de otras ómicas (proteómica / genómica) ya que no es constante y está cambiando muy rápidamente. La metabolómica es el vínculo entre el genotipo y el fenotipo. A un nivel muy básico en la metabolómica, el objetivo es comprender qué metabolitos son responsables del fenotipo. En un nivel más avanzado, comienza a conectar los bits de esta información para tener una idea de cómo funcionan las cosas a nivel de biología del sistema. Tan pocos ejemplos, con tantas características y fenotipos, utiliza técnicas de selección variable y reducción de la dimensionalidad. Técnicas de clasificación para encontrar los biomarcadores de la enfermedad. Redes neuronales para profundizar en la biología de sistemas y el análisis complejo. Agrupación para comprender más sobre metabolitos desconocidos / conocidos.

Existe mucha literatura sobre algoritmos de aprendizaje automático ya utilizados en metabolómica

Actualmente, para la normalización de datos a gran escala, la anotación de características, la predicción de fragmentos MSMS también adopta métodos de aprendizaje automático.

Sin embargo, en mi opinión, en comparación con la proteómica, la base de datos incompleta y no específica de la especie siempre limita la aplicación de aprendizaje automático, especialmente para métodos superivizados