Solo consigue una GPU.
Las GPU modernas son tan potentes que una gran cantidad de aprendizaje profundo que solía requerir supercomputadoras ahora se puede hacer en una sola PC de escritorio con una GPU potente.
Casi toda la investigación de DL en la industria y en la academia se realiza en GPU ahora.
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Incluso una GPU relativamente barata ($ 100- $ 200) funcionará si no le importa esperar un poco más por sus resultados.
Recomiendo una biblioteca como Theano que tenga soporte intercambiable transparente para GPU (lo que significa que escribe su código una vez, y puede simplemente activar un interruptor para que se ejecute en GPU vs CPU).
Además, obtén NVIDIA. El soporte de OpenCL en las bibliotecas de aprendizaje profundo es mucho peor que CUDA.
Hago todas mis tareas de aprendizaje profundo en una GTX 780, y por lo general me lleva menos de una hora entrenar incluso redes relativamente grandes.