Es posible que los componentes que estén más juntos en una placa base pequeña disminuyan el tiempo que tarda una señal en llegar desde el punto A en una placa base hasta el punto B (digamos una señal desde la ranura PCIe más alejada).
Sin embargo, las placas base más pequeñas también tienden a ser placas base económicas. Supongo que un fabricante de placa base económica podría haber hecho otros compromisos que niegan cualquier beneficio de que los componentes estén más juntos.
Ahora, dadas dos placas base con componentes de igual calidad … dado que un pie es aproximadamente un nanosegundo … la diferencia entre una placa base ATX y una placa base micro-ATX sería bastante escasa en la práctica.
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TL; DR: compre la placa base que satisfaga sus necesidades, no espere ningún beneficio real de una placa base más pequeña en informática de uso general o uso doméstico.