Un lugar para comenzar (donde comencé para una clase de Python para bioinformática) es tratar de regenerar figuras de documentos que te parezcan interesantes. Los enlaces a los datos sin procesar / normalizados se enumerarán en el documento y, si su sección de métodos es buena, tendrá una manera de determinar cómo analizaron los datos. Una vez que pueda crear las figuras del documento, puede jugar con los datos para hacer preguntas sutilmente diferentes.
También practiqué la codificación escribiendo un script que toma una lista de genes y devuelve una lista de 7mers (secuencias de 7 nucleótidos) que se comparten entre los 3 ‘UTR de los genes que alimenté. Quería ver si sería factible crear microARN sintéticos que apunten a un grupo de genes en una vía importante para un tipo particular de células inmunes en lugar de tratar de atacarlos a todos individualmente. Este no fue un problema terriblemente difícil, pero me obligó a aprender acerca de los diferentes tipos de objetos y métodos para acelerar el script de modo que tomara segundos en lugar de más de 30 minutos (como sucedió con la primera versión del script).
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