La fragmentación del disco no ocurre en Linux debido a la forma en que los archivos se almacenan en el disco.
Cuando utiliza un sistema de archivos basado en Windows (FAT / NTFS), almacena los datos en los sectores del disco a medida que se escriben. Por ejemplo, si crea un documento de Word en C: \ y lo guarda, se les asignan sectores específicos en su disco. Ahora, un mes después, cuando edita ese documento y lo vuelve a guardar, la nueva parte del documento puede almacenarse en otro lugar y no cerca de los sectores antiguos. Por lo tanto, se ha producido una fragmentación y cada vez que abre este documento, el cabezal del disco debe buscarlo desde dos (o más) lugares diferentes, lo que consume más tiempo. Para resolver esto, ejecuta una utilidad de desfragmentación de disco en Windows de vez en cuando, para que reorganice todos sus datos almacenados y los lleve de nuevo a un lugar.
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Este problema no ocurre en los sistemas de archivos basados en Linux (ext4 / ext3), porque esa función es manejada por el propio sistema de diario de Linux. Linux cambia automáticamente los datos cuando detecta una fragmentación en los archivos antes de guardarlos.