De Wikipedia con resumen hecho por mí:
Data Science = es un campo interdisciplinario sobre métodos, procesos y sistemas científicos para extraer el conocimiento o las percepciones de los datos en varias formas, ya sea estructuradas o no, de manera similar a Knowledge Discovery en bases de datos (KDD).
Aprendizaje automático = es el subcampo de la informática que brinda a las computadoras la capacidad de aprender sin ser programado explícitamente (Arthur Samuel, 1959). Evolucionado del estudio del reconocimiento de patrones y la teoría del aprendizaje computacional en inteligencia artificial, el aprendizaje automático explora el estudio y la construcción de algoritmos que pueden aprender y hacer predicciones sobre los datos: dichos algoritmos se superan siguiendo instrucciones estrictamente estáticas del programa al hacer predicciones o decisiones basadas en datos, mediante la construcción de un modelo a partir de entradas de muestra. El aprendizaje automático se emplea en una variedad de tareas informáticas en las que no es factible diseñar y programar algoritmos explícitos; Las aplicaciones de ejemplo incluyen el filtrado de spam, la detección de intrusos en la red o personas maliciosas que trabajan en busca de una violación de datos, reconocimiento óptico de caracteres (OCR), motores de búsqueda y visión por computadora.
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Parece que hay una diferencia. El aprendizaje automático hace que las máquinas sean más independientes (sobre estudiar, aprender cosas), Data Science le brinda la capacidad de extraer datos en varias formas.