¿Es seguro eliminar una carpeta de información de volumen del sistema de un pen drive?

Sí y No. Depende del formato de la unidad USB.

Básicamente, la carpeta Información del volumen del sistema es una carpeta oculta del sistema que la herramienta Restaurar sistema utiliza para almacenar su información y restaurar puntos. Hay una carpeta de información del volumen del sistema en cada partición de su computadora. [1]

Pero ni siquiera puede abrirlo incluso si tiene acceso de administrador porque Windows lo usa para funciones de nivel de sistema y no desea que el usuario interfiera con funciones importantes.

Si intenta abrirlo, obtendrá un error como este

No debe eliminar la carpeta Información del volumen del sistema en unidades con formato NTFS, Windows normalmente no le permite acceder a esta carpeta, mucho menos eliminarla. [2]

En las unidades con formato exFAT o FAT32, puede elegir eliminar la carpeta, pero Windows simplemente la recreará en el futuro, ya que la necesita.

Notas al pie

[1] https://support.microsoft.com/en…

[2] ¿Qué es la carpeta “Información del volumen del sistema” y puedo eliminarla?