Bueno, Fedora es para todo tipo de geeks aventureros y otras personas a las que les gusta vivir en la vanguardia, y está instalado en computadoras de varios tamaños, aunque nunca he oído hablar de una supercomputadora o mainframe que ejecute específicamente Fedora.
Si quiere decir “sistemas basados en rpm” frente a “sistemas basados en deb”, esa es una pregunta diferente. SuSE Linux Enterprise y Red Hat Enterprise Linux se consideran las “distribuciones Enterprise Linux”, no por el formato del paquete, sino por el hecho de que estas 2 compañías fueron las primeras en ponerse de pie como proveedores de distribuciones comerciales compatibles de Linux. Pero Canonical ofrece soporte empresarial para Ubuntu, y cuenta con clientes como wikipedia, pero es un mercado difícil de descifrar hoy en día.
Por lo tanto, debian & ubuntu pueden ejecutarse en sistemas grandes, incluido el hardware mainframe de IBM, así como en las “distribuciones empresariales” y no conozco ninguna limitación técnica que impida que se ejecuten en una supercomputadora.
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Espero que tenga sentido.