La respuesta corta es sí. Por supuesto, puede usar un servidor de Windows para alojar un sitio web. La mayoría de los sitios web de Internet están alojados en Linux / Unix, pero más sitios web de intranet están alojados en el servidor de Windows.
Si debe usarlo depende de las características de su sitio web y si está más familiarizado con Windows o Linux (en desarrollo web y alojamiento).
Si su sitio web es mayormente estático y no requiere una base de datos, no importa si usa Windows o Linux, y podría usar un servicio de alojamiento web basado en la nube. (DriveHQ ofrece servicio de alojamiento web estático).
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Si su sitio web es dinámico y está familiarizado con las herramientas de Visual Studio de Microsoft, utilizar el servidor de Windows será una buena opción; de lo contrario, si está familiarizado con Apache, PHP, Java y muchas otras herramientas de código abierto, entonces debería usar Linux.