Creo que ambos continuarán coexistiendo.
Los sitios “estáticos” con mucho contenido, como Wikipedia, están bien servidos como sitios web normales con una página y una URL para cada recurso. No habría una ventaja obvia en convertir wikipedia en una verdadera aplicación de una sola página. De hecho, tiene mucho sentido tener una URL para cada recurso real: fácil de indexar, buscar fácilmente.
Los servicios experimentales, interactivos y altamente personalizados parecen ser mejor atendidos por el modelo de “aplicación”. En general, esto se hace mediante la creación de servicios y la exposición de una API (es decir, Twitter) que luego se puede utilizar para crear aplicaciones de clientes. Estas pueden ser aplicaciones web, aplicaciones web optimizadas para dispositivos móviles o clientes nativos para Mac, Windows, iOS o Android, etc.
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Creo que los servicios más interesantes que existen actualmente y * la mayoría * que se construirán en un futuro próximo tenderán a encajar en la segunda categoría o al menos serán una forma de híbrido de los dos. Con el empuje de la historia de HTML5 y los enfoques de etiqueta hash más clásicos, es posible casar los dos enfoques. Estos híbridos pueden tener una página principal de aplicación interactiva (me viene a la mente la nueva página de inicio de Twitter), pero también tienen enlaces a páginas más estáticas (como los enlaces permanentes de Twitter para tweets individuales) para proporcionar un medio de catalogar el historial y proporcionar a los motores de búsqueda una forma de acceder e indexar la información.
En última instancia, la elección se realizará en función de los objetivos del servicio. Sin embargo, si la nueva generación de servicios es una indicación, las “aplicaciones” están aquí para quedarse y serán cada vez más dominantes.