No hay problemas, aparte de la peculiaridad habitual del conductor. Como señaló Quora User, http://www.atheros.cz es una colección no oficial y no compatible de variados controladores Atheros, pero los controladores de referencia pueden no funcionar bien con su combinación específica de hardware y sistema operativo. Esto es especialmente cierto para las computadoras portátiles.
Además, varias tarjetas MiniPCIe (internas) apagarán sus radios si detectan que están instaladas en un sistema en el que no han sido certificadas. Las tarjetas MiniPCIe están certificadas por la FCC con un combo de antena / chasis específico, y si detectan que están instaladas en una configuración diferente, se negarán a comenzar para evitar la violación de las regulaciones.
No dice nada sobre los detalles de su instalación, así que eso es lo mejor que puedo hacer con la especulación.
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En general, es mejor usar un dongle USB que tenga la radio y la antena agrupadas.