Todos ellos. Todo programa no trivial es un gráfico. Llamadas a funciones, acceso variable y alcance, objetos, todo eso es teoría de grafos.
Si desea algo más explícito, cada método de administración de memoria. La marca y barrido más simple implica crear un árbol de expansión de un dígrafo. El uso eficaz del recuento de referencias requiere la conciencia de los gráficos cíclicos y acíclicos.
¿Quieres algo más específico? Juegos de aventura. Quizás cada uno no es genial, pero hay cientos o miles de ellos. Las ubicaciones son vértices y el movimiento entre ellas requiere un recorrido transversal. La ayuda automática requiere encontrar caminos entre ellos. Hacer que los objetos desaparezcan cuando se usan implica una simple demostración de teoremas dinámicos.
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El internet es bastante bueno. Es una gráfica. El objetivo de Internet es la curación dinámica y el redireccionamiento, que requiere una teoría de gráficos distribuidos. DNS