Si he oído hablar de ellos, los algoritmos probablemente no sean terriblemente nuevos 🙂 En muchos casos, los algoritmos más antiguos que nunca fueron completamente explotados están siendo revividos.
Los filtros Bloom y las estructuras de datos probabilísticas relacionadas son sin duda un tema candente.
Alineador de orden parcial para alineación de secuencia múltiple / generación de consenso
- Cómo encontrar todos los palíndromos posibles que se pueden generar usando las letras de una cadena dada
- Cómo hacer búsquedas difusas eficientes usando la distancia levenshtein
- ¿Cuáles son algunos buenos nombres de variables / métodos junto con la descripción donde encajan?
- ¿Cuál es la estructura de datos utilizada para realizar la recursividad?
- ¿Vale la pena publicar mi algoritmo?
Ensamblar genomas extremadamente grandes y complejos con lecturas largas y ricas en errores y con mezclas de tipos de datos, por ejemplo, Abyss 2.0, FALCON, MaSuRCa.
Área de interés: la disponibilidad de un secuenciador altamente portátil, rápido y en tiempo real (Oxford Nanopore MinION) supera muchos límites: el análisis de datos en tiempo real (especialmente para la secuenciación selectiva), el manejo de lecturas largas muy ruidosas, la búsqueda de modificaciones en la base, la búsqueda bases de datos en dispositivos de clase smartphone
