¿Te refieres a unidades físicas o particiones? Toda la unidad C, la unidad D, la unidad E … el negocio es estrictamente una cosa de DOS / Windows. GNU / Linux utiliza un esquema completamente diferente y menos ambiguo para referirse a los dispositivos de bloque de las particiones y unidades completas.
Si esta cosa que está llamando una “unidad E:” es una unidad externa, eso es bastante fácil de hacer en sistemas basados en BIOS, solo dígale al sistema que inicie ese dispositivo.
Si se trata de una unidad interna, puede ser solo un poco más difícil. Todo esto desaparece en los sistemas basados en UEFI, especialmente en el momento en que se involucra el “Arranque seguro”. (Si va a arrancar algo además de Windows, recomendaría deshabilitar por completo el “Arranque seguro”, pero esa es otra queja).
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Si se trata de una partición en su unidad existente, eso podría ser un poco más complicado y requerir un cargador de arranque personalizado. Tenga en cuenta al actualizar Windows que, al menos en el pasado, el gestor de arranque a menudo se reinicia para arrancar solo Windows (probablemente intencional por parte de Microsoft, y por ninguna razón realmente buena que no sea frustrar a los usuarios de arranque dual con la esperanza de que lo hagan renunciar y arrancar solo Windows a partir de entonces). No estoy seguro de si esto se lleva a la era UEFI o no, pero vale la pena tenerlo en cuenta.