¿Qué es STRING (www.string-db.org)?

Gracias por A2A,

Me gustaría ampliar primero la abreviatura de STRING, que es la herramienta de búsqueda para la recuperación de genes / proteínas interactuantes. Y ahora que. Esto claramente le da una idea de que esta es una herramienta web o específicamente una base de datos que proporciona información sobre las interacciones gen-proteína o, más precisamente, almacena información sobre las interacciones proteína-proteína conocidas y predichas.

Si lees la página wiki tienes mucha idea

STRING – Wikipedia

¿Cómo funciona? Consulta el tutorial Tutorial de STRING / STITCH

Por qué lo necesitamos Sabemos que los procesos celulares o las funciones biológicas sistémicas se deben a interacciones de proteínas o grupos de proteínas. Por lo tanto, para estudiar la estructura, las funciones y las propiedades de estas proteínas y qué interacción podrían tener entre ellas y que probablemente puedan dar lugar a algunas funciones biológicas, podríamos necesitar tales bases de datos.

La idea básica es entender si uno tiene un grupo de proteínas si funcionan de manera interactiva o no según la teoría de redes. Sin embargo, la base de datos tiene interacciones tanto conocidas (validadas experimentalmente) como predichas. Esto nos permite identificar las redes de proteínas subyacentes para varios procesos biológicos que podrían haberse desencadenado. Espero que esto ayude.