Probablemente no exista una respuesta absoluta. Depende de sus preferencias, compatibilidad con los miembros del equipo y la capacidad de operar algunas marcas de software que podrían no estar disponibles en ambos (ciertos productos CAD, por ejemplo).
En Los Alamos teníamos un montón de ambos, pero las Mac eran dominantes como la plataforma preferida para la mayoría del trabajo técnico, en gran parte debido a que era una verdadera plataforma UNIX debajo, con lenguajes de shell programables (como csh) y herramientas poderosas como awk, sed y tr, etc. Estos permiten una poderosa capacidad para manipular grandes conjuntos de datos ad hoc.
Sin embargo, a veces, cierto software necesario para un proyecto solo puede estar disponible en una PC. Debido a la naturaleza de nuestro trabajo, muchos de nosotros teníamos uno de cada uno, más un cuaderno.
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En un momento, tenía una Mac, Sun Sparcstation, PC, Macbook y Silicon Graphics en el escritorio al mismo tiempo. Era prácticamente una sala de control.
Entonces, puedo conducir cualquier cosa, pero mi preferencia personal es, con mucho, la Mac, por lo que sea que valga la pena.