Si te refieres al curso Coursera de Andrew Ng, entonces la respuesta fácil es el curso de Abu-Mostafa en edX. Es un curso mejor, porque estaba destinado a ser así.
El curso de Ng en curso solo está aplicando Machine Learning para resolver algunos problemas. No aprenderás de dónde vienen las ecuaciones. Es sobre todo intuición y luego te da las ecuaciones, implementas el algoritmo y todos están contentos. Por otro lado, el curso Caltech es un curso real de Machine Learning, el mismo que se da a los estudiantes de Caltech.
Creo que es un poco injusto comparar los cursos (para decir cuál es mejor), porque tienen diferentes objetivos y se dirigen a diferentes grupos. El curso de Ng está dirigido a más programadores que desean aprender una o dos cosas para Machine Learning, mientras que el curso de Mostafa está dirigido a personas que realmente quieren estudiar Machine Learning, y si no eres bueno en matemáticas, te perderás en ese curso.
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Sin embargo, el profesor Ng ha publicado los videos y el material de apoyo de su curso impartido en Stanford, y eso es algo completamente diferente. Prefiero ese al curso de Abu-Mostafa porque prefiero la forma en que el profesor Ng explica las cosas, pero no puedes equivocarte con ninguno de ellos. Ambos son profesores de primer nivel que saben de qué están hablando.