¿Dónde nos llevará la investigación genómica impulsada por la informática en 5 años?

En primer lugar, solo puede haber investigación genómica “impulsada por computadora”. No se lleva a cabo ninguna investigación genómica en ausencia de biología computacional, de lo contrario los datos son inmanejables. Hay demasiados datos, demasiados falsos positivos, etc.

Entonces, considero que esta pregunta significa: ¿dónde estaremos dentro de 5 años de investigación genómica? Este es mi tipo de preguntas menos favorito, pero las responderé igual porque se hicieron durante la sesión; de lo contrario hubiera pasado. ¿Por qué? Los seres humanos son muy malos para predecir el futuro, incluso si es un futuro no muy lejano, pero nos encanta pensar que podemos hacer predicciones significativas. La experiencia ha demostrado una y otra vez que la mayoría de estas predicciones resultan inútiles. Sugiero leer Pensamiento, rápido y lento: Daniel Kahneman: 9780374533557: Amazon.com: Books and The Drunkard’s Walk: How Randomness Rules Our Lives: Leonard Mlodinow: 9780307275172: Amazon.com: Books.

Con esa advertencia , esto es lo que creo que podemos ser con respecto a la investigación genómica dentro de 5 años:

  1. Habrá numerosos canales de análisis de datos totalmente automatizados para producir informes estandarizados de hallazgos genómicos; por ejemplo, secuenciación del genoma completo, RNA-Seq, etc.
  2. La genómica se utilizará para el diagnóstico clínico, o para otros tipos de pruebas, de manera bastante rutinaria, al menos en los países desarrollados, y especialmente para el cáncer. La genómica personalizada será una realidad.
  3. Podemos ver más secuenciación del genoma completo de los recién nacidos, pero no mucho, debido a problemas de privacidad
  4. Habremos secuenciado numerosos organismos no humanos, especialmente organismos marinos, que revelarán ideas fascinantes sobre la evolución y la ecología.
  5. La secuenciación del microbioma se convertirá en rutina para muchas aplicaciones, incluidas algunas aplicaciones médicamente relevantes y ambientalmente relevantes.

Estos son lo suficientemente generales como para que algunos resulten ser predicciones precisas.

Estoy trabajando en un sistema de vigilancia autónomo y automatizado para patógenos, brotes y reconstrucción de árboles de transmisión. Comenzando con la hepatitis C, luego otras hepatitis infecciosas, VIH y otras cosas que se transmiten de manera similar.

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