No están relacionados, y creo que esta es una pregunta incorrecta.
Todo ingeniero de redes, con o sin certificación, debe mantenerse al día con la evolución constante del panorama de las redes.
Una red al final del día incluye un conjunto de hosts, dispositivos de reenvío, diversos medios de comunicación entre ellos y una enorme bolsa de protocolos. Todos estos han evolucionado progresivamente durante décadas. Hubo un tiempo en que el WiFi nunca existió. Cada edición SIGCOMM generalmente trata sobre un nuevo mecanismo de control de congestión TCP. RDMA también es reciente. Diablos, las redes de paquetes conmutados no eran una cosa alguna vez.
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SDN, en pocas palabras, simplemente implica una separación del plano de control y el plano de datos. No cambia mucho acerca de una red, excepto que ahora, (generalmente) a través de un controlador lógicamente centralizado, ahora puede programar el plano de reenvío y administración de dispositivos. Prácticamente todo lo demás sobre una red, incluidos todos los protocolos que solían existir, así como los dispositivos como conmutadores y enrutadores, aún permanecen.
Normalmente no soy un fanático de las certificaciones, pero entiendo que ayuda a mucha gente. Sin embargo, la clave aquí es que al evaluar a un ingeniero de redes, una certificación en sí misma casi no tiene sentido en comparación con sus habilidades y qué tan bien se han mantenido al día con la evolución de la red.
Entonces, para responder a su pregunta: la llegada de SDN puede o no hacer que CCIE quede obsoleto. Realmente depende de la calidad del ingeniero mismo.