La mayoría de los lugares donde ML ha tenido mucho éxito son aplicaciones derivadas de humanos y / o son relativamente fáciles de razonar. Procesamiento de imágenes, lenguaje natural, venta de anuncios; estas son todas las aplicaciones de ML a artefactos creados por humanos (fotos, dibujos, lenguaje, deseos, necesidades humanas, etc.) Si bien este no es siempre el caso, muchas veces podemos modelar cosas creadas por humanos porque podemos formular base racional interpretable para el modelo o tener una idea clara de cómo debería funcionar.
En muchos sentidos, la biología es lo opuesto a esto. El razonamiento sobre los sistemas biológicos es desafiante porque el 99% del tiempo no son sistemas que construimos, no nos acercamos a comprenderlos completamente, y están muy conectados y son multivariados. Casi siempre ocurre que no conocemos todas las variables, no sabemos cómo interactúan, y no sabemos la naturaleza de cada variable y cómo interactúa con otros niveles en la jerarquía biológica (p. Ej. bimolecular, celular, sistema de órganos, individuo y población).
Ahora combine eso con la forma en que recopilamos los datos en un sistema biológico: es posible que tengamos que usar varias tecnologías complejas para interrogar a un sistema, y estaremos sujetos a sesgos, suposiciones y, sobre todo, limitaciones (de las cuales hay muchas ) de cada.
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También está el hecho muy crítico de que en biología (y especialmente en medicina), a menudo no estamos interesados en tener un modelo que funcione: necesitamos un modelo que tenga sentido y se pueda explicar. Especialmente en medicina, es un gran problema si no podemos entender cómo funciona un modelo, incluso si logra un rendimiento incomparable.