Técnicamente no. Un verdadero clon sería un byte por copia de byte de los medios originales. Sin embargo, puede crear una imagen de su disco que excluya ciertos datos.
Un producto comercial con esta capacidad que viene a la mente es Acronis True Image. Puede haber otro software de imágenes que admita la exclusión de archivos o carpetas (es posible que Paragon Disk Manager no lo haya usado por un tiempo), pero el único caso de uso real que justifica el costo del software para mí es si no tiene un almacenamiento intermedio dispositivo lo suficientemente grande como para contener toda la imagen del disco de su unidad fuente
El método gratuito de código abierto es crear una imagen sin formato del disco utilizando su método favorito (dd en GNU \ Linux funciona bien) y guardar el archivo en una unidad lo suficientemente grande. Luego monte cualquier partición en la nueva imagen de la que desea eliminar archivos y proceda a eliminar los datos de destino (también puede cambiar el tamaño de las particiones según sea necesario si está escribiendo en un disco de diferente tamaño, pero esto requiere un poco más de trabajo; sfdisk ayuda mucho si esto es necesario). Una vez que esté satisfecho con el contenido de la imagen, puede escribirla en el disco de destino (unidad de reemplazo o lo que sea) y terminar con el mismo resultado.
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(Esta respuesta fue escrita principalmente con otros técnicos en mente, por lo que puede que no sea muy accesible para el Quorian promedio. Para cualquier persona interesada en una explicación adicional, independientemente de su capacidad técnica, siéntase libre de comentar, ya que estaré encantado de dar más detalles).