¿Cuáles son las diferentes startups de genómica computacional basadas en la nube?

Resuelven un problema similar para cualquier solución basada en la nube; eliminan la necesidad de soporte de TI local (es decir, para adquirir, instalar, mantener y reparar una infraestructura computacional que consiste en servidores y equipos de red).

Técnicamente, en lo que se refiere a la secuenciación de próxima generación, simplifican las complejidades de ensamblar una tubería y pueden proporcionar orientación sobre su uso apropiado.

Knome, por ejemplo, ofrece anotación de genoma completo y exoma completo y análisis de datos en múltiples muestras, algo con lo que otros proveedores luchan. Ingenuity, otra compañía de bioinformática de servicios basados ​​en la nube, ofrece anotaciones profundas basadas en muchos años de análisis de literatura. Hay varios otros, pero estos son algunos de los principales que están trabajando duro para diferenciarse.

En cuanto a la necesidad del mercado, solo hay un aumento lineal en el número de biólogos computacionales, pero un aumento exponencial en el número de muestras analizadas y los datos generados. Además de esto, hay proyectos que superponen múltiples tipos de datos (es decir, variantes de un solo nucleótido con datos de expresión de RNA-Seq) y, por lo tanto, son un ejemplo clásico de un problema de Big Data.

Por último, AWS es líder en el espacio de proveedores (en el back-end), con muchos proveedores que los utilizan, aunque Google y Microsoft (Azure) están involucrados de diferentes maneras (ver DNAnexus); IBM y HP (y otros proveedores importantes de TI) también están analizando esto de cerca.

Realmente está haciendo dos preguntas (“¿Cuáles son las diferentes startups de genómica computacional basadas en la nube” y “¿Qué problemas están resolviendo?”) Contestaré la primera y podemos abordar la segunda a través de comentarios si es necesario (es amable de complicado).

Aquí hay algunas startups de genómica relacionadas con la nube:

Dale Yuzuki es correcto, las nuevas empresas de genómica computacional basadas en la nube están tratando de resolver el problema de administrar, acceder, analizar y / o visualizar datos de secuencias de ADN a gran escala. El costo de la secuenciación del ADN se ha reducido drásticamente y ahora la industria enfrenta los desafíos del cuello de botella del análisis de datos.

Aquí es donde entra en juego DNAnexus. DNAnexus aborda el cuello de botella del análisis de datos de secuencia de ADN al aprovechar el poder computacional de la nube de forma escalable, ayudando a organizar e indexar cantidades masivas de datos, así como a proporcionar herramientas especializadas para visualizar y analizar.