Esta no es una pregunta simple para responder.
En primer lugar, debe especificar “otro sistema operativo”; esto incluiría sistemas operativos como OpenBSD, Solaris, OpenVMS y más.
En segundo lugar, la seguridad de una distribución de Linux depende de la configuración y de lo que ejecute en ella.
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Un proveedor de shell (una organización que proporciona una línea de comando al público) informó su experiencia con Linux. Tenían problemas con la seguridad, con los piratas informáticos, etc. al ejecutar Linux en sistemas x86. Cuando cambiaron a NetBSD en máquinas SPARC, su problema desapareció.
Ahora, para un usuario normal, la experiencia del proveedor de shell no será suya, pero el problema de determinar qué es seguro depende de lo que necesita ejecutar y cómo lo ejecuta.
Para la experiencia de código abierto lista para usar más segura, recomiendo OpenBSD. Hay muchas distribuciones de código abierto que se centran en la seguridad de una forma u otra; El sitio Distrowatch puede proporcionar una lista de todas las distribuciones en la categoría Seguridad.
La respuesta simple es que depende del sistema operativo que se compara, de la configuración, de la seguridad que desee o necesite y del software instalado.