Si puede predecir la estructura tridimensional de una proteína a partir de su estructura primaria (la secuencia cruda de aminoácidos), ha aumentado enormemente nuestra comprensión de la biología celular y nuestra capacidad para diseñar medicamentos.
Esto se conoce como predicción de la estructura de la proteína y es un problema fascinante en biología computacional. Se puede abordar de muchas maneras diferentes, ya sea aprendiendo de estructuras conocidas o tratando de resolver la física de los enlaces, o ambas. Incluso hay una competencia semestral para que los equipos intenten predecir la estructura de las proteínas que están a punto de determinar su estructura experimentalmente.
En una nota relacionada, hay una variedad de problemas asociados con el acoplamiento, que es el estudio de la interacción estructural entre una molécula pequeña y una grande, como una proteína. Hacer un progreso significativo en nuestra capacidad de predecir tales interacciones puede ayudar enormemente a la ciencia del diseño de medicamentos.
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Hay muchos otros problemas en biología computacional, bioinformática y campos relacionados. Muchos de ellos tienen el potencial de transformar vidas, algunos más que otros (no existe un acuerdo universal sobre cuáles tienen el mayor potencial).