Tanto Windows como Both Linux serían más seguros que Linux en un lado y Windows en el otro.
El uso de diferentes sistemas en cada extremo haría que la conversación fuera más vulnerable, los puntos débiles en cualquiera de ellos la harían vulnerable.
La seguridad suele ser una cuestión de menos
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Y para su caso específico, diría “A”.
Sería más difícil responder si hubiera incluido un escenario de Windows / Windows, pero como Windows tiene una desagradable acumulación de fallas de seguridad y es un sistema mucho más grande que Linux. Y como el usuario promedio de Windows es menos experto en tecnología y más propenso a los malos hábitos de seguridad que el usuario promedio de Linux, seguiría siendo Linux / Linux el más seguro
Pero el sistema operativo no es realmente la parte más crítica de su problema, el uso de la criptografía es el punto crítico, y también es esencial tener ambas computadoras limpias de código malicioso (y no asuma que Linux está limpio por defecto).