Lo que necesitará para optimizar su método de clasificación son algunos conjuntos de datos de “verdad fundamental”. Los conjuntos de datos de verdad de tierra son grabaciones eléctricas intracelulares y extracelulares que se realizan simultáneamente en la (s) misma (s) celda (s).
El propósito de la clasificación es identificar una plantilla de “unidad”. Se puede considerar que una unidad es una sola célula, un nodo en la red más grande. Esa neurona tendrá una firma particular en ese canal extracelular, que puede identificarse por la forma de la forma de onda. Esa plantilla es un rastro típico para esa unidad disparando sobre ese electrodo. Si está utilizando matrices de electrodos múltiples (MEA) o tetrodes, que tienen múltiples canales de grabación extracelulares, entonces esa celda tendrá una firma de plantilla diferente en otro electrodo basado principalmente en su ubicación a ese otro tetrodo. Las huellas reales registradas variarán de la plantilla exacta debido al ruido. El ruido es tu enemigo en las grabaciones extracelulares.
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Sin embargo, después de todo ese trabajo de clasificación de picos, todavía no estamos seguros de si eso fue realmente una célula que provocó un cambio de voltaje. Todo lo que realmente sabemos es que un pico que pasó un umbral particular tiene una forma de onda particular que parece aparecer repetidamente, y parece ser distinta de todo lo demás que aparece en ese electrodo. Se podría argumentar que lo que estás viendo es solo ruido. Es solo el ruido que pasó al pasar los filtros y el umbral de detección / extracción. Es solo el ruido que tiene la misma forma y aparece repetidamente. Tu clasificación es basura. ¿Mencioné que el ruido es tu enemigo en las grabaciones extracelulares?
Aquí es donde entran en juego los conjuntos de datos de la verdad fundamental. Dado que tiene grabaciones tanto intracelulares como extracelulares, puede confirmar las marcas de tiempo de sus picos ordenados con las marcas de tiempo de disparo real registradas intracelularmente. Ahora sus picos ordenados pueden ser verdaderamente validados para la precisión. La mayoría de los laboratorios académicos cargan sus conjuntos de datos de verdad en alguna parte. Algunos que me gustan son:
hc-1 – CRCNS.org
Evaluación de Spikesorting | Bienvenido
Validación de electrodos
SpikeSortingTest.com
