Imagine una gran biblioteca, con muchos estantes para almacenar libros. Por alguna razón, esta biblioteca almacena libros por capítulo, cada capítulo tiene su propia portada. Cada vez que obtienes un libro grande, encuentras un buen lugar para juntarlos. Cada vez que obtienes un libro pequeño, simplemente lo arrojas a cualquier lugar, es pequeño y pronto será destruido. Con el tiempo, la biblioteca comienza a llenarse y hay menos espacio. Un día obtienes un libro grande y descubres que no hay lugar para que quepa todo de una vez, así que lo divides en dos y colocas las dos secciones en diferentes lugares. Luego, otro gran libro, y otro, y otro, hasta que lea un libro, necesita correr por la biblioteca en busca del próximo capítulo. La desfragmentación mira todos los libros y capítulos en esta biblioteca, luego organícelos, reuniendo todos los capítulos juntos, para que cuando termine un capítulo pueda pasar directamente al siguiente.
Desfragmentar es un concepto muy similar, calcular qué fragmentos de datos pertenecen a qué programa y ponerlos uno al lado del otro para mejorar los tiempos de búsqueda de los discos duros.
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